天野雪辉（富樫美铃 配音）是一个平日里喜欢在手机中记录日常琐事的孤僻少年，一日偶然间，他发现自己居然拥有了能够预知未来的“未来日记”，而此时，兴奋又好奇的他并不知道，自己已经被卷入了一场永无止尽的杀戮游戏中去。作为控制整个游戏的时空之神，宙斯（若本规夫 配音）选中了12名年龄和职业各异的男女，赋予他们拥有不同能力的“未来日记”，而他们所要做的，就是尽其所能利用自己的日记逃避同伴的追杀并且尽可能的杀死同伴。失败的人将和日记一同消失，而最后的胜利者，可以成为下一届游戏的神。
就是这样毫无理由的残酷游戏，作为同学一直爱慕着雪辉的我妻由乃（村田知沙 配音）也被卷入其中，他们将面对的，是怎样强大的对手呢？善良单纯的他们能够逃脱神的掌控吗？

　　由于童年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，沉默寡言，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正直开朗稳重可靠的枣恭介（绿川光 配音），四肢发达头脑简单的井之原真人（神奈延年 配音），成熟勇敢剑术一流的宫泽谦吾（织田优成 配音）四人出现在了绝望的理树面前。他们自称“Little Busters”，想要利用理树的力量来完成拯救世界的重任。
　　就这样，理树成为了LB中的一份子，整日奔波解决一些说来宏大但其实十分平凡的委托。在相处的过程中，本来行为举止十分怪异的同伴们渐渐的变得可爱起来，理树也逐渐敞开了紧闭的心门，找回了久违的快乐。他开始明白，只要有一颗开朗向上的心，这样的生活一定能够继续下去直到永远。 

故事发生在大正十四年，那是一个女子地位极其卑微的年代，除了在家相夫教子，女孩们几乎没有别的出路。然而，就是在这样的年代中，不愿为命运所桎梏的大小姐小笠原晶子（中原麻衣 配音）下定了一个可以说是疯狂的决心——成立一支女子棒球队。
　　作为晶子的好友，个性单纯开朗的铃川小梅（伊藤加奈惠 配音）当然要鼎力相助。同时，头脑灵活的川岛乃枝（植田佳奈 配音）、威信极高的班长宗谷雪（能登麻美子 配音）、运动健将月映巴（甲斐田裕子 配音）和其妹妹月映静（喜多村英梨 配音）等人也都逐渐加入了晶子的棒球队，在众人的非议声中，一支特殊的女子棒球队就这样成立了。这群走在时代前沿的女孩子们，会有怎样又笑有泪的经历在等着她们呢？

由于混血的外貌和金色的头发，个性其实十分善良的少年羽濑川小鹰（木村良平 配音）成为了众人孤立的对象，这让他十分的苦恼。同样的，脸色难看个性孤僻的少女三日月夜空（井上麻里奈 配音）也只能在课后和自己幻想中的朋友有说有笑。这样两个孤独的人相遇了，一个专门为了交朋友而成立的社团“邻人社”应运而生。
没想到，社团一经成立，居然招来了诸多个性奇怪的美少女——喜欢玩美少女游戏的美少女柏崎星奈（伊藤加奈惠 配音），外表是妹子实则是爷们的楠辛村（山本希望 配音），超级高智商少女志熊理科（福圆美里 配音），中二病重度患者羽濑川小鸠（花泽香菜）等等。这些没有朋友的家伙们聚在一起，居然也在不知不觉中交到了许多的朋友呢。