《毒枭：墨西哥》第 2 季继续讲述米格尔·安赫尔·费利斯·加拉多的故事，他现在是墨西哥第一大贩毒集团（瓜达拉哈拉贩毒集团）的教父，一直在努力保持对各方势力的掌控，发展自己的帝国，在成为教父的路上不断调和所面对的背叛与牺牲。随着贩毒集团不同“广场”之间的摩擦加剧，费利斯对局势的掌控也随之减弱。同时，贩毒集团手上的血债（缉毒局探员奇奇·卡马雷纳之死）和腐败的政治家在墨西哥引发了一系列因果报应。由坚定的缉毒局探员沃尔特·布列斯林领导的“莱茵达行动”并不总是按常规出牌，且矛头直指费利斯·加拉多和他的心腹，进一步导致了贩毒集团的不稳定和动荡。

恰逢1993年2月28日发生在卡梅尔山的悲剧事件30周年之际，本剧聚焦于韦科灾难的余波：对大卫教派幸存成员的审判和本土恐怖分子蒂莫西·麦克维的崛起。这部五集的限定剧还为美国民兵运动的升级提供了更广泛的背景，这为俄克拉荷马城爆炸案和1月6日美国国会大厦的袭击埋下 了伏笔。

回墨西哥拜訪家人時，這個寂寞的男孩認識了一隻躲在爺爺牧場的神祕生物，接著展開畢生難忘的冒險旅程。

吉姆（连姆·尼森 Liam Neeson 饰）曾经是为了海军陆战队卖命的神射手，退休之后，他来到了位于亚利桑那州边境的一座牧场之中，过起了离群索居的生活。一场意外中，吉姆目睹了一位名叫罗莎（特蕾莎·鲁伊斯 Teresa Ruiz 饰）的年轻母亲遭到墨西哥毒贩追杀的场面，临死之前，罗莎将自己年仅11岁的儿子米格尔（雅各布·佩雷斯 Jacob Perez 饰）托付给了吉姆。