该剧时间设定在《刺猬索尼克2》与《刺猬索尼克3》之间，纳克鲁斯（伊德里斯·艾尔巴 Idris Elba 配音）同意收韦德·威波（亚当·佩里 Adam Pally 配音）为徒、并将他训练成真正的针鼹战士。

索尼克在绿丘镇安顿下来之后，就急着要证明自己有能力成为一名真正的英雄。当蛋头博士带着全新的搭档纳克鲁斯，又回来寻找一块力量强大足以毁灭人类文明的翡翠的时候，他就面对了另一个严峻的考验。这次索尼克和他自己的跟班塔尔斯携手合作，一起踏上一场环游世界的冒险旅程，希望能在那块翡翠落入坏人手中之前先找到它。

不断出现的人类互相伤害事件，让蝙蝠侠意识到背后神秘的魔法力量作祟。为探寻究竟，他联合了康斯坦丁的超自然团队。