上一部结尾，尼奥（基奴李维斯 饰）终于意识到自己的能力和使命，中弹复活后，变成了无所不能的“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），舰长墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）回到了人类的基地锡安，受到人们的热烈欢迎。

澳大利亚墨尔本，华裔厨师积奇（成龙 饰）是当地小有名气的人物，定期在电视上主持烹饪节目。

某香港科技大亨的女儿失踪，Breslin发现罪犯是自己一个老对手的疯狂儿子，他还绑架了Breslin的爱人Abigail，并把她关在名为“恶魔车站”的巨大监狱里。Breslin将和自己的团队硬闯虎穴，试图劫狱。