神奈川新机场被用面具遮住脸的武装团体“兽”占据。再次被卷入事件的武藏，向1年前的事件以来，休职中的管理官·和泉樱请求协助。情报分析官志摩和新的朋友也加入其中，从机场救出人质，“消灭”比前作的“鬼”更危险的“兽”。另一方面，在横浜湾医院握手术刀的武藏的妻子心脏内科医生裕子也被卷入了某 个事件。解救人质的期限只有一天。“兽”们的真面目、目的、还有武藏家的命运是什么呢?

讲述1923年间，从16岁就开始从事间谍三年杀害57人的百合，帮助小男孩慎太的传奇故事。

“TOKYO MER”正式认可半年。为了在全国政令指定城市开展MER，代替离开队伍的音羽（贺来贤人）的第二医生问题让喜多见（铃木亮平）头痛不已。在队伍内希望比奈（中条绫美）升格的声音也提高，不过，音羽断言比奈应该向循环器外科的道前进。比奈也感到压力，烦恼着能不能代替音羽。这时，青户（伊藤淳史）作为支援医生来到MER。青户和音羽一样是厚生劳动省的医科技术官，表面上是作为第二医生候补的派遣，但那里有厚生劳动省方面的想法。

本作でジェシーが演じるのは政治家の息子・利根川豪太。「父親の言いなりになって政治家になるのは嫌だ」と思っていた豪太は、ひょんなことからお笑い養成所に入学し、プロの芸人を目指すことになる。